硅胶内衬套的选用应综合考虑截肢者残肢尺寸、残肢软组织状况、截肢者活动级别和配件的使用。
1、尺寸选择
根据测量出的残肢围长尺寸及残肢长度来选择相吻合的硅胶内衬套。错误的尺寸会导致截肢者感觉不舒服、排汗和减低对假肢的控制能力。
2、残肢软组织
1、残肢的坚实程度各有不同，有些是肉质多，有些是多骨的。如果残肢末端多肉质，选用稳定型硅胶内衬套，它可以更有效地控制软组织。如果残肢末端多骨质，选用护理型硅胶内衬套，它有更厚的衬垫用来覆盖残肢末端突出的骨质部分。
3、截肢者活动级别
低强度活动级别指日常活动使用辅助步行工具，慢速和稳定的行走，如在房屋内走动，在社区范围内的轻量行走；中强度活动级别指日常活动只限于普通行走，有能力变速或随意行走，如出外购物，独立户外行走；高强度活动级别指日常活动可以快速行走，缓步跑或上下楼梯，如轻量的搬运工作。
4、硅胶内衬套配件
标准硅胶内衬套是设计成适合大部分残肢形状的末端伞状圆桶形。当截肢者的残肢形状在不正常或不规范的范围内，则残肢与硅胶内衬套之间不能全面接触，这时可选择合适的配件与硅胶内衬套配套使用来实现形状吻合。伞形护垫和半月形护垫可供选择适于残肢末端是方形、平的或锥形。
初穿戴硅胶内衬套残肢可能会排很多的汗，多数情况下经过一段时间的适应调整会减退至消失，不同制造商生产的硅胶内衬套产品略有差异，大概几周至几个月；残肢出汗也与活动增加、气候变化等有关。有些硅胶内衬套易吸收体味和汗液，要求穿戴者有良好的卫生习惯，勤于清洗。每晚休息时，脱下假肢后用柔性无味的洗剂（约pH 5.5）清洗残肢及硅胶内衬套，最好涂抹残肢护理液，使其彻夜起作用，再次穿戴前皮肤和硅胶内衬套保证干燥清洁。若皮肤有过敏的迹象，用酒精或消毒剂清洗硅胶内衬套内层面，并清洗残肢，皮肤上不能留肥皂块以免刺激皮肤。
截肢者在穿戴硅胶内衬套过程中，可能碰到一些皮肤问题，如近端、远端水泡，皮肤表层囊肿，髌骨红肿，大面积皮肤刺激等。其外在因素多是机械摩擦、水合、化学及热力等，内在因素多是疾病、过敏、感染等。建议使用专用切割器修剪硅胶内衬套口形部分成波浪式，在口形圈附近涂抹些凡士林或戴层袜套，检查硅胶内衬套的尺寸选择、滚动穿戴方式及配套零部件的使用，必要时调换粘性低的硅胶内衬套等方法来解决问题。
